5 borse di ricerca nell’ambito del Progetto PON “BIO OPEN LAB – Rafforzamento del capitale umano”. Bando B7/2023

Scadenza: 17/09/2023 Ore: 23:59

Riferimento Bando: B7/2023

 

Il presente avviso è finalizzato all’assegnazione di n. 5 borse di ricerca, della durata di n. 12 mesi, rinnovabili qualora si rendessero disponibili fondi aggiuntivi e/o ulteriori, per lo svolgimento di attività di ricerca nell’ambito del Progetto PON “BIO Open Lab (BOL) – Rafforzamento del capitale umano” – CUP J72F20000940007. Leggi la Scheda Progetto.

Le attività dei borsisti si inseriranno, in particolare, nell’ambito dell’Obiettivo Realizzativo 1 (OR1)  del Progetto BOL rivolto alla creazione di una facility di Next Generation Sequencing, composta da un Laboratorio dedicato ad analisi nel campo della genomica ed epigenomica e da un Datacenter a supporto dell’elaborazione, gestione e fruizione del dato scientifico prodotto.

Le borse di ricerca sono ripartite su 5 profili, si legga con attenzione il bando per maggiori dettagli su ogni profilo:

Profilo A
Tema della ricerca: “Individuazione di nuovi approcci ed algoritmi di Deep Learning di tipo Unsupervised e analisi delle loro rappresentazioni”.
Per questo profilo, il borsista, sotto la supervisione del Responsabile scientifico della ricerca, sarà impegnato a supportare le attività di individuazione di nuovi approcci ed algoritmi di Unsupervised DL, dalle potenzialità di applicazione tecnologica, sui seguenti temi: clustering e analisi di dimensionalità intrinseca, tecniche di riduzione di dimensionalità (lineari e non lineari), modelli auto-regressivi.

Profilo B
Tema della ricerca: “Setup dell’infrastruttura computazionale per l’addestramento e la distribuzione degli algoritmi per ricercatori afferenti al progetto”.
Per questo profilo, il borsista, sotto la supervisione del Responsabile scientifico della ricerca, sarà impegnato a supportare le seguenti attività:
• assistenza nel setup dell’infrastruttura di calcolo necessaria per l’implementazione ottimizzata di algoritmi sulle piattaforme HPC disponibili, e sperimentazione della loro efficacia su dataset reali;
• benchmarking di infrastrutture software e hardware per le operazioni fondamentali;

Profilo C
Tema della ricerca: “Algoritmi di Intelligenza Artificiale per la Proteomica e la Genomica”.
Per questo profilo, il borsista, sotto la supervisione del Responsabile scientifico della ricerca, sarà impegnato a supportare le seguenti attività:
• scouting della letteratura recente per l’individuazione di nuovi approcci ed algoritmi di DL, dalla potenzialità di applicazione tecnologica;
• sperimentazione su dati di Proteomica e Genomica;
• validazione dei nuovi approcci e algoritmi su datasets reali.

Profilo D
Tema della ricerca: “Benchmarking di infrastrutture SW e HW per le operazioni di trasferimento dati e implementazione ottimizzata di algoritmi su piattaforme HPC”.
Per questo profilo, il borsista, sotto la supervisione del Responsabile scientifico della ricerca, sarà impegnato a supportare le attività di benchmarking di infrastrutture software e hardware per le operazioni fondamentali per operazioni di trasferimento dati, a supporto dell’implementazione di pipelines di calcolo avanzate per dati di NGS.

Profilo E
Tema della ricerca: “Tecniche di gestione del dato scientifico”.
Per questo profilo, il borsista, sotto la supervisione del Responsabile scientifico della ricerca, sarà impegnato a supportare le seguenti attività:
• studio e implementazione degli approcci secondo i principi FAIR ai dati;
• definizione delle procedure per far sì che gli utilizzatori dell’infrastruttura siano in grado di arrivare a mettere a disposizione il più possibile dataset e strumenti di analisi in modalità open;
• sviluppo di workflow per la generazione del dato in modalità “Fair-by-design”.

Per tutte le borse descritte in questo avviso, l’attività di ricerca sarà svolta presso la sede dell’Area di Ricerca Scientifica e Tecnologica di Trieste – Area Science Park sita in Strada Statale 14 della Venezia Giulia, 34149 Basovizza, Trieste e/o sita in Padriciano 99, 34149 Trieste.

Il Responsabile del procedimento amministrativo di cui al presente avviso è Stefano Cozzini – Direttore Istituto Ricerca e Tecnologie. Informazioni possono richiedersi via e-mail, scrivendo all’indirizzo: stefano.cozzini@areasciencepark.it.


Il Progetto rientra nell’ambito dei finanziamenti finalizzati al Rafforzamento del capitale umano delle Infrastrutture di Ricerca, in attuazione del Piano Stralcio “Ricerca e Innovazione 2015-2017” – “PNIR- Programma Nazionale Infrastrutture di Ricerca” (Avviso di cui al D.D. n. 2595 del 24 dicembre 2019) e concesso con Decreto n. 1728 del 02/11/2020 del Direttore generale per il coordinamento e la valorizzazione della ricerca e dei suoi risultati.